MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY07

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009473	CAG	2	6	987	992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244128
2	NC_009473	TCG	2	6	1025	1030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244128
3	NC_009473	TGG	2	6	2844	2849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244129
4	NC_009473	CTG	2	6	2873	2878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244129
5	NC_009473	CCG	2	6	2897	2902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244129
6	NC_009473	CG	3	6	2921	2926	0 %	0 %	50 %	50 %	148244129
7	NC_009473	CCA	2	6	3025	3030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244129
8	NC_009473	CAC	2	6	3052	3057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244129
9	NC_009473	GGC	2	6	3172	3177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244129
10	NC_009473	TGC	2	6	3228	3233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244129
11	NC_009473	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244129
12	NC_009473	GGC	2	6	3286	3291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244129
13	NC_009473	CGG	2	6	3321	3326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244129
14	NC_009473	TGC	2	6	3420	3425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244130
15	NC_009473	CGG	2	6	3469	3474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
16	NC_009473	TGG	2	6	3517	3522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244130
17	NC_009473	GCG	2	6	3525	3530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
18	NC_009473	GGGCAG	2	12	3542	3553	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148244130
19	NC_009473	CCTG	2	8	3673	3680	0 %	25 %	25 %	50 %	148244130
20	NC_009473	GGC	2	6	3794	3799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
21	NC_009473	GGC	2	6	3851	3856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
22	NC_009473	GTG	2	6	4026	4031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244130
23	NC_009473	ATG	2	6	4035	4040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244130
24	NC_009473	CGG	2	6	4159	4164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
25	NC_009473	CGG	2	6	4228	4233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
26	NC_009473	CGG	2	6	4237	4242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
27	NC_009473	CGA	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244130
28	NC_009473	GGC	2	6	4385	4390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
29	NC_009473	GCG	2	6	4392	4397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
30	NC_009473	CGGA	2	8	4659	4666	25 %	0 %	50 %	25 %	148244131
31	NC_009473	CGA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244131
32	NC_009473	AGC	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244131
33	NC_009473	GC	3	6	4734	4739	0 %	0 %	50 %	50 %	148244131
34	NC_009473	AGG	2	6	4759	4764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244131
35	NC_009473	CGC	2	6	4770	4775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244131
36	NC_009473	AGCGG	2	10	4808	4817	20 %	0 %	60 %	20 %	148244131
37	NC_009473	ATCG	2	8	4875	4882	25 %	25 %	25 %	25 %	148244131
38	NC_009473	GGC	2	6	4925	4930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244131
39	NC_009473	GCCC	2	8	4950	4957	0 %	0 %	25 %	75 %	148244131
40	NC_009473	GC	3	6	5097	5102	0 %	0 %	50 %	50 %	148244132
41	NC_009473	GGC	2	6	5115	5120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244132
42	NC_009473	CGA	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244132
43	NC_009473	C	6	6	5219	5224	0 %	0 %	0 %	100 %	148244132
44	NC_009473	GCG	2	6	5236	5241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244132
45	NC_009473	TGAGCC	2	12	5265	5276	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148244132
46	NC_009473	GAC	2	6	5374	5379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244132
47	NC_009473	GGCG	2	8	5396	5403	0 %	0 %	75 %	25 %	148244132
48	NC_009473	GC	4	8	5425	5432	0 %	0 %	50 %	50 %	148244132
49	NC_009473	AGG	2	6	5441	5446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244132
50	NC_009473	GCC	2	6	5455	5460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244132
51	NC_009473	GGGC	2	8	5482	5489	0 %	0 %	75 %	25 %	148244132
52	NC_009473	GC	3	6	5505	5510	0 %	0 %	50 %	50 %	148244132
53	NC_009473	CCA	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244132

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.